Ως γνωστόν το εκκλησάκι χτίστηκε επί τουρκοκρατίας από τον κλεφταρματωλό Βασίλη, κι έπαιξε σημαντικό ρόλο το 1825, όταν μετά από σειρά μαχών που έδωσε εκεί ο Γεώργιος Καραϊσκάκης, κατάφερε και εξεδίωξε τους 2.400 Τούρκους από το στρατόπεδο του Παλιόκαστρου, κι απελευθέρωσε έτσι το Απόκουρο.
Η παράδοση λέει πως ο Καραϊσκάκης πήγε στον Άϊ-Θωμά, προσκύνησε την εικόνα του Αγίου, κι έβαλε την υπογραφή του στο πίσω μέρος της εικόνας.
Έκτοτε οι Πετροχωρίτες φυλάσσουν ως κειμήλιο την εικόνα του Αγίου Θωμά, που είναι Αγιογραφημένη το 1817.
Ο Άγιος Θωμάς. είναι σήμερα ο Κοιμητηριακός Ναός του Πετροχωρίου και περιλαμβάνεται στα Βυζαντινά μνημεία της περιοχής, με λιγοστές δυστυχώς Αγιογραφίες των αρχών του 19-ου αιώνα.
